“野生與家養綿羊全基因組重測序揭示外型及生產性狀相關基因”在國際知名學術期刊《自然通訊》在線發表
原發表日期：2020-06-18
來源：科技日報
作者：科技日報記者?朱彤?通訊員 陳遂中
6月18日從新疆農墾科學院獲悉，近日，新疆農墾科學院省部共建綿羊遺傳改良與健康養殖國家重點實驗室與中國農業大學李孟華教授研究團隊合作的研究成果“野生與家養綿羊全基因組重測序揭示外型及生產性狀相關基因”在國際知名學術雜志《自然通訊》在線發表。該研究成果不僅為綿羊遺傳學研究提供了寶貴的基因組資源，也對今后開展分子設計育種、指導家養綿羊遺傳改良具有重要指導意義。
專家將鑒定好的胚胎移植給受體羊
綿羊體外胚胎生產
該研究是新疆農墾科學院省部共建綿羊遺傳改良與健康養殖國家重點實驗室自2016年1月投入建設運行以來，充分發揮柔性引進高層次人才科研方向的引領作用，在綿羊遺傳資源評價與性狀遺傳機制解析方面所取得的重大研究進展，也是重點實驗室與內地高水平科研院所開展合作研究，充分發揮新疆綿羊資源優勢和中國科學院動物研究所人才與技術優勢所取得的重要成果。
動物馴化是家畜多樣性發展的重要起源事件，也是人類文明發展的重要先決條件。綿羊作為最早被馴化的動物之一，經過長期的自然選擇與高強度的人工選擇，已經形成1400多個表型豐富的現代綿羊品種，是為人類提供肉、毛、皮、奶等產品的重要家畜。利用高深度全基因組重測序數據，鑒定表型性狀相關功能變異對指導基因組輔助育種有著重要意義。近期雖有從基因組層面分析綿羊的馴化和育種研究，但都存在樣本量較少、測序深度低和表型數據不夠充足等局限。
2016年10月，由中國科學院動物研究所研究員（現中國農業大學教授）牽頭啟動了針對全球特色綿羊品種資源重測序和全基因組關聯分析的合作研究項目，項目在省部共建綿羊遺傳改良與健康養殖國家重點實驗室兵團專項建設資金、國家自然科學基金杰青項目、面上項目以及中國科學院對外合作項目等多個項目的支持下，在探索綿羊馴化、揭示綿羊尾脂形態等表型及生產性狀的遺傳機制方面取得重要研究進展。
該研究通過對來自世界各地的包括野羊（亞洲摩弗倫）和家養綿羊在內的43個品種共計284個個體進行高深度全基因組測序，全面深入地揭示了綿羊在馴化、培育改良以及表型性狀選擇上的遺傳機制。
實驗室建設論證會
通過比較近緣野生綿羊和5個古老的家羊品種(來自非洲、中東、歐洲、亞洲)全基因組數據，鑒定出261個可靠的候選基因，并進一步挖掘了36個已在綿羊及其它物種中發現的且具有功能注釋的馴化基因(與免疫、繁殖、生長、行為等相關)，針對這些基因，發現了6個在野生和家養綿羊間等位基因頻率分布差異極顯著的非同義突變位點。通過對所有家羊進行基于群體分化指數Fst的綿羊全基因組選擇信號檢測，篩選了一系列與毛細度、奶產量、窩平均產羔數和尾型等性狀相關的候選基因。經實驗驗證，發現PDGFD基因是影響綿羊尾部脂肪沉積的重要因果基因。（圖片均由新疆農墾科學院宣傳教育處供圖）
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